BIPP-метод

Медицинская энциклопедия – значение слова Bipp‑ме́тод

(истор.)
метод лечения инфицированных ран, вскрытых карбункулов и т.п. висмуто-йодо-формо-парафиновой пастой.

Смотреть значение Bipp‑ме́тод в других словарях

Метод — м. и метода ж. способ, порядок, основания; принятый путь для хода, достижения чего-либо, в виде общих правил. -дический, порядочный, правильный, основательный, постепенный;……..
Толковый словарь Даля

Метод — (нов. офиц.). Сокращение, употр. в новых сложных словах в знач. методический, напр. методбюро.
Толковый словарь Ушакова

Метод М. И Устар. Метода Ж. — 1. Способ познания, подход к изучению явлений природы и общественной жизни. 2. Прием, система приемов в какой-л. области деятельности.
Толковый словарь Ефремовой

Метод… — 1. Начальная часть сложных слов, вносящая значение сл.: методический (методбюро, методкабинет, методобъединение и т.п.).
Толковый словарь Ефремовой

Аналитический Метод Прогнозирования — Метод прогнозирования, основанный на получении экспертных оценок путем логического анализа прогнозной модели.
Политический словарь

Бихевиоральный Метод — (от англ. “бихевиор” – поведение) – в политологии предполагает исследование политических явлений и процессов через анализ поведения индивидов и групп при исполнении……..
Политический словарь

Дельфийский Метод, Метод Делфи — Метод коллективной экспертной оценки, основанный на выявлении согласованной оценки экспертной группы путем их автономного опроса в несколько туров, предусматривающего……..
Политический словарь

Матричный Метод Прогнозирования — Метод прогнозирования, основанный на использовании матриц, отражающих значения (веса) вершин граф-модели объекта прогнозирования, с последующим преобразованием матриц……..
Политический словарь

Метод — – средство анализа, способ проверки и оценки знания.
Политический словарь

Метод Деструктивной Отнесенной Оценки — Метод коллективной генерации идей, реализуемый посредством двух разнесенных во время сессий, первая из которых полностью подчиняется правилам коллективной генерации……..
Политический словарь

Метод Индивидуальной Экспертной Оценки — Метод прогнозирования, основанный на использовании в качестве источника информации одного эксперта.
Политический словарь

Метод Интервью — Метод индивидуальной экспертной оценки, основанный на беседе эксперта с прогнозистом по схеме “вопрос — ответ”.
Политический словарь

Метод Исторической Аналогии — Метод прогнозирования, основанный на установлении и использовании аналогии объекта прогнозирования с одинаковым по природе объектом, опережающим первый в своем развитии.
Политический словарь

Метод Коллективной Генерации Идей — Метод коллективной экспертной оценки, основанный на стимулировании творческой деятельности экспертов путем совместного обсуждения конкретной проблемы, регламентированного……..
Политический словарь

Метод Коллективной Экспертной Оценки — Метод прогнозирования, основанный на выявлении обобщенной объективированной оценки экспертной группы путем обработки индивидуальных, независимых вынесенных……..
Политический словарь

Метод Математической Аналогии — Метод прогнозирования, основанный на установлении аналогии математических описаний процессов развития различных по природе объектов с последующим использованием……..
Политический словарь

Метод Построения Прогнозного Сценария — Аналитический метод прогнозирования, основанный на установлении логической последовательности состояний объекта прогнозирования и прогнозного фона во времени при……..
Политический словарь

Метод Прогнозирования — Способ исследования объекта прогнозирования, направленный на разработку прогнозов. Примечание. Методы прогнозирования являются основанием для методик прогнозирования.
Политический словарь

Метод Психо-интеллектуальной Генерации Идей — Метод индивидуальной экспертной оценки, при котором выявление экспертной оценки осуществляется с помощью программированного управления, включающего обращение к……..
Политический словарь

Метод Управляемой Генерации Идей — Метод коллективной генерации идей с использованием целенаправленного интеллектуального воздействия (усиливающего или подавляющего) на процесс генерации идей.
Политический словарь

Метод Эвристического Прогнозирования — Аналитический метод прогнозирования, состоящий в построении и последующем усечении дерева поиска экспертной оценки с использованием какой-либо эвристики.
Политический словарь

Метод Экспертных Комиссий — Метод коллективной экспертной оценки, состоящий в совместной работе объединенных в комиссию экспертов, разрабатывающих документ о перспективах развития объекта прогнозирования.
Политический словарь

Опережающий Метод Прогнозирования — Метод прогнозирования, основанный на использовании свойства научно-технической информации опережать реализацию научно-технических достижений в общественной практике.
Политический словарь

Патентный Метод Прогнозирования — Опережающий метод прогнозирования, основанный на оценке (по принятой системе критериев) изобретений и исследовании динамики их патентования.
Политический словарь

Публикационный Метод Прогнозирования — Опережающий метод прогнозирования, основанный на оценке публикаций об объекте прогнозирования (по принятой системе критериев) и исследовании динамики их публикования.
Политический словарь

Синоптический Метод — Метод прогнозирования, основанный на анализе экспертами известного множества прогнозов объекта прогнозирования и прогнозного фона с последующим их синтезом.
Политический словарь

Системный Метод В Политологии — – рассмотрение политики как целостного, сложно организованного, саморегулирующегося механизма, находящегося в непрерывном взаимодействии с окружающей средой.
Политический словарь

Сравнительный Метод В Политологии — – сопоставление однотипных политических явлений и процессов и выявление их общих черт и специфики с целью нахождения оптимальных форм политической организации или путем решения задач.
Политический словарь

Статистический Метод Прогнозирования — Фактографический метод прогнозирования, основанный на построении и анализе динамических рядов характеристик объекта прогнозирования.
Политический словарь

Фактографический Метод Прогнозирования — Метод прогнозирования, базирующийся на использовании источников фактографической информации.
Политический словарь

Посмотреть в Wikipedia статью для Bipp‑ме́тод

Источник: http://slovariki.org/medicinskaa-enciklopedia/16631

Методы бизнес-анализа

Поскольку на хабре не было найдено подобных статей, решил внести свой вклад, а также надеюсь, что кому-то эта информация пригодится в его дальнейшей деятельности.

Итак, почему бизнес-анализ на сайте ИТ-направленности? Ответ будет несколько скучным для читателя – организации хотят оптимизировать свою работу и функционировать максимально эффективно. Во многих случаях (хотя и не во всех) выходом из ситуации является использование ИТ.

Примером можно назвать автоматизацию работы сотрудников, более эффективное использование имеющихся ресурсов, оптимизация процессов и т. д. Вот так информационные технологии стали рядом в помощь. Тема на самом деле довольно интересная и материалов на русском или украинском языках довольно мало.

На мой взгляд, одной из причин этому есть относительно недавнее его появление. Хотя следует добавить, что методы, о которых мы будем вести речь рассматриваются по отдельности во многих учебниках на многих языках.

Определение бизнес-анализа возьмем из Википедии, чтобы не придумывать велосипед:

«Бизнес-анализ — дисциплина выявления деловых потребностей и нахождения решений деловых проблем»

Однако, есть и другое определение. Согласно своду знаний о бизнес-анализе (Business Analysis Body of Knowledge 2.0):

«Бизнес-анализ является набором заданий и методик, которые предназначены использоваться в качестве связующего звена между участниками бизнеса с целью понять структуру, правила и функции организации и предложить решения, которые позволят организации достичь поставленных целей».

В значительной степени источником для данной статьи служил как раз свод знаний о бизнес-анализе, который автор в данный момент активно изучает.

По сути

Для вступления достаточно и мы переходим непосредственно к самой сути статьи. Анализ, как метод научного познания, выражается изучением объекта путем разбиения его на составные части.

Для бизнеса это наиболее выгодный метод, поскольку любой бизнес — это система, состоящая из составных частей, которые взаимодействуют между собой с целью получить прибыль (или в случае некоммерческих организаций — принести пользу или ценность).

Наши заграничные коллеги в похожих случаях используют слово «value», которое словари трактуют как «стоимость» или «ценность». Как мы можем анализировать бизнес? С какой стороны к нему подойти? На самом деле, подходить можно и нужно с разных сторон, чтобы построить целостное представление о его составляющих и их работе.

Для выполнения задач бизнес-анализа используются различные методы. Причем для выполнения одной задачи могут служить как один так и несколько методов. Довольно просто общих слов — перейдем к более конкретным вещам.

Наиболее часто используемыми на практике среди бизнес-аналитиков являются следующие методы:

• Определение критериев принятия и оценки;
• Мозговой штурм;
• Анализ бизнес-правил;
• Словарь данных и глоссарий;
• Диаграммы потоков данных;
• Моделирование данных;
• Анализ принятия решений;
• Анализ документов;
• Интервью;
• Метрики и ключевые показатели производительности;
• Анализ не функциональных требований;
• Моделирование организации;
• Отслеживание проблем;
• Моделирование процессов;
• Практические занятия по выявлению требований;
• Сценарии и варианты использования.

Данные методы могут включать в себя подмножества методов (как например метод моделирования данных).

Метод определения критериев принятия и оценки

Целью метода является определение критериев, которым должны соответствовать критерии для того, чтобы они были приняты заинтересованными лицами.

Согласно определению, критерии в данном методе разделяются на два класса:

• Критерии принятия (каким требованиям решение должно соответствовать, чтобы был смысл в его реализации);
• Критерии оценки (какими требованиями руководствоваться для выбора между несколькими решениями).

Данные критерии должны поддаваться тестированию, а в случае, если их нельзя протестировать — разбиваться на меньшие требования, которые можно протестировать. Стоит заметить, что имеет смысл ранжировать критерии по степени значимости. Свод знаний по бизнес-анализу упоминает о достоинствах и недостатках метода.

Достоинства

• Для agile разработки может быть необходимым, чтобы все требования были выражены в форме, которая позволяет протестировать соблюдение этих требований;
• Критерии принятия необходимы, когда требования выражают договорные обязательства.

Недостатки

• Критерии оценки или принятия, выраженные договорными обязательствами может быть проблематично изменить в силу юридических или политических причин.

Мозговой штурм

Целью метода является генерирование новых идей, которые будут служить материалом для дальнейшего анализа.

Вопросы, которые могут найти ответ могут быть следующими:

• Как мы можем решить проблему сейчас (подручными средствами)?
• Какие препятствия стоят перед нами для выбора определенного решения или подхода?
• Что может вызвать задержку?
• Как мы можем решить проблему?

Для проведения мозгового штурма необходимо подготовить четкое определение темы для обсуждения, временных рамок, определить ожидания от данного обсуждения, определить критерии для оценки идей и выбрать соответствующих людей с определенным опытом в сфере, которая подлежит обсуждению. В процессе проведения мозгового штурма все идеи должны предлагаться без обсуждения, критики или оценки и при этом участники штурма могут строить новые идеи на основе предложенных ранее. Кроме того, все идеи должны быть записаны. В конце штурма необходимо обсудить идеи и выкинуть дублирующиеся. Результатом будет список идей, которые в той или иной мере должны ответить на поставленные вопросы.

Преимущества

• Возможность сформировать большое количество идей за короткий промежуток времени;
• Включает креативное мышление;
• Может помочь снять напряжение между участниками совещания.

Недостатки

• В значительной степени зависит от желания людей участвовать в штурме, а также стоит учитывать межличностные отношения, которые могут ограничить активность участников;
• Участники не должны создавать дебатов вокруг идей, что предлагаются. Тоесть мозговой штурм может перерасти в дебаты и потраченное впустую время.

Анализ бизнес-правил

Целью метода является выявление правил, которые определяют, ограничивают или разрешают определенную деятельность, работу или функционирование. В целом, правила должны поддерживать цели организации, но их не должно быть слишком много.

• Правила должны быть определены терминами, которые будут понятны исполнителям;
• Правила не должны содержать описаний как они будут поддерживаться;
• Должны быть определены в декларативной форме на самом базовом уровне (тоесть не должны потом разбиваться на еще несколько);
• Правила должны быть отделены от процессов;
• Правила должны поддерживаться так, чтобы организация могла поддерживать их в актуальном состоянии.

Правила могут быть резолютивными или структурными, в зависимости от того, на чем они делают акцент.

Пример резолютивного правила (которое определяет поведение участников процесса):

Сотрудник должен получить письменное разрешение от директора департамента безопасности на использование на работе личного ноутбука.

Или

Перед слиянием в главную ветку разработчик должен протестировать код.

Пример структурного правила (которое определяет структуру знания, что позволяет определить правдивость, ложность или отношение к определенной категории):

Оплата принимается только безналичным расчетом.

Или

Индекс выполнения сроков определяется как EV / PV, где EV — освоенный объем, а PV — плановый объем.

Преимущества

• Четкое определение правил раздельно от процессов позволяет организации менять правила без изменения процессов.

Недостатки

• Правила могут вступать в конфликты друг с другом, что должно регулярно проверяться с появлением новых правил или изменением старых.

Словарь данных и глоссарий

Как свод знаний по бизнес-анализу, так и методология Val IT одной из основ для успешной деятельности организации ставят использование единой терминологии заинтересованными сторонами.

Кроме того, это упрощает процесс дальнейшего анализа и сбора требований, поскольку участники понимают о чем именно идет речь и могут понятно и четко излагать свои требования.

Так, метод выделяет две составляющие:

Глоссарий — список терминов и их определение.

Словарь данных — словарь, который включает в себя список данных, их определение и допустимые или возможные значения. Словарь данных может также определять комбинации, в которые данные могут объединяться.

Словарь данных состоит из простых элементов и составных.

Простые элементы содержат следующую информацию:

• Название — уникальное имя;
• Псевдонимы (aliases) — другие названия, которые используют заинтересованные стороны для этого понятия;
• Значения — возможные значения, которые может принимать элемент;
• Описание — определение элемента в контексте решения.

Составные элементы формируются из простых. Их структура следующая:

• Последовательности — показывают порядок простых элементов (в последовательностях простые элементы всегда определяются в четко определенной последовательности);
• Повторения — показывают, что простые элементы могут несколько раз появляться в составном элементе;
• Опциональные элементы — могут присутствовать или отсутствовать в составном элементе.

Диаграммы потоков данных

Тема диаграмм потоков данных воистину достойна отдельной статьи. Существуют различные нотации (например известная всем Гейна-Сарсона в BPWin, которую многие наверняка составляли в ВУЗах или Йордана). Но вернемся обратно.

Целью диаграмм потоков данных (DFD) является отображение входа, обработки, хранения и выхода информации из системы.

Диаграммы описывают:

• Внешние сущности, которые получают информацию от системы или ее отдают ей;
• Процессы систем, которые преобразуют данные;
• Хранилища данных, где информация сохраняется определенное время;
• Потоки данных, по которым данные перемещаются между внешними сущностями, процессами и хранилищами данных.

Пример одной из таких диаграмм приведен ниже: Звездочкой отмечен простой элемент данных, который является опциональным. Кстати, на диаграмме нужно было бы показать что результатом сообщения об ошибке должен быть ответ заказчику с исправленной ошибкой. Кстати, добавляйте свои примеры диаграмм — интересно было бы увидеть как другие описали бы тот же прием и обработку сообщений об ошибках. В целом же можно привести и другой пример: Диаграммы рисовались в Dia, которая является образцом ужаса в отрисовке диаграмм под GNU/Linux.

Заключение

Хотя мы и рассмотрели лишь часть из методов (которых существуют десятки), часть из них вы наверняка используете и надеюсь, что вам было интересно.

Ссылки:

1. Business Analysis Body of Knowledge Overview
2. Val IT

• бизнес-анализ
• val it
• методы

Источник: https://habr.com/post/124164/

Биоимпедансометрия – что это такое?

Биоимпедансометрия – это анализ количества жира и жидкости в организме, мышечной и костной массы и метаболизма. И все – в одной процедуре. Звучит заманчиво, но оправдает ли на деле ваши ожидания? Так что же такое биоимпедансометрия, как проводится процедура и стоит ли ему доверять такому методу?

14.03.2016

Биоимпедансометрия (Bioelectrical impedance analysis, BIA), или биоимпедансный анализ – это распространенный метод определения состава человеческого тела через измерение электрического сопротивления в тканях.

То есть, проще говоря, через тело пропускают слабый электрический заряд, измеряют сопротивление (импеданс), что дает представление об общем содержании воды в организме (total body water, TBW).

Так как вода содержится в основном в крови, в мышцах, нервах, костях, то через содержание воды вычисляют тощую (нежировую) массу тела, а потом, через вычитание из общей массы тела – массу находящегося в организме жира.

Биоимпедансометрия считается более точным методом, чем вычисление индекса массы тела (ИМТ), так как учитывает не только рост и вес, но и соотношение жировой и нежировой массы. Это тот самый анализ, который способен показать отличие между жирком и «широкой костью».

Как проводится биоимпедансометрия?

В общих чертах: к телу прикрепляется два электрода, через которые пропускают слабый ток. На основании данных о прохождении заряда через тело компьютер высчитывает требуемые показатели.

Процедура безболезненна, а комфорт зависит от используемого аппарата: они бывают очень разными, за некоторые просто нужно держаться ладонями или встать, как на напольные весы, а другие требуют, чтобы вы легли, и датчики крепятся к стопам и кистям.

Расшифровка результатов биоимпедансометрии

Биоимпедансометрия, помимо жировой и нежировой массы, определяет еще много параметров. Не запутаться вам поможет врач, который все объяснит, но хорошо бы заранее знать, на какие вопросы вы получите ответы.

Итак, что измеряет биоимпедансометрия и что означают ее результаты?

1. Количество жидкости в организме. Определяет объем внутриклеточной, а также меж- и внеклеточной жидкости. Показатель межклеточной жидкости позволяет узнать, нет ли в организме отеков, не задерживается ли жидкость.

Если количество межклеточной жидкости, то есть крови и лимфы, ниже нормы, это указывает на сгущение крови или на то, что вы недостаточно пьете, особенно если при этом подвергаетесь физическим нагрузкам.

В норме количество жидкости в организме составляет 45-60% массы тела.

2. Индекс массы тела. Знаменитый ИМТ, который точно знают озабоченные похудением люди, можно определить разными способами, и биоимпедансометрия – один из них. ИМТ – это степень соответствия массы тела росту. Нормальным вес считается при значении ИМТ 18,50-24,99. Ниже – недостаточная масса тела, выше – избыточная. Ожирение начинается при ИМТ от 30.

3. Скорость основного обмена. Она же: основной метаболизм, базальный метаболизм. Это количество калорий, которое сжигает организм в состоянии покоя за сутки.

Эти калории необходимы для жизнедеятельности, и организм их «съест» в любом случае, будете ли вы физически активны или нет.

Для каждого это число индивидуально, чем оно выше, тем быстрее вы тратите энергию; чем оно ниже, тем вероятнее набор лишнего веса даже при правильном питании.

4. Активная клеточная масса, или АКМ. Это масса внутренних органов, костей, мышц, нервных клеток в совокупности (включая находящуюся в них жидкость).

Недостаток ее может говорить о заболеваниях внутренних органов, например, щитовидной железы, и об общем нездоровье. Полезно следить за изменением АКМ, когда вы худеете, чтобы похудение проходило не за ее счет, а за счет жира.

В норме АКМ составляет 75-85% от веса тела.

5. Мышечная масса. Все просто: это общая масса мышц в теле. Этот показатель полезно знать спортсменам и тем, кто занят силовыми тренировками, чтобы узнать, эффективны ли они. Хотите стать сильнее – это тот самый параметр, на который нужно обратить внимание.

При неправильном питании, неверной диете и образе жизни вместо жира человек теряет мышечную массу (тем более, она уходит гораздо легче жировой), при этом вес снижается, но это не то похудение, о котором вы мечтали.

В здоровом теле мышечная масса составляет 30-40% от общей.

6. Костная масса. Недостаток ее может говорить об остеопорозе и других заболеваниях, которые ведут к повышенному риску переломов. Этот параметр чаще всего отклоняется от нормы при несбалансированном питании, и тогда его режим следует пересмотреть.

Костная масса тесно связана с содержанием кальция в организме, а он, как известно, нужен не только для крепости костей, но и для работы мышц и нервной системы, свертываемости крови.

Как и остальные значения, костная масса зависит от веса, и в норме выходит примерно:

7. Жировая масса, то есть, количество жира в организме. То самое, ради чего худеющие проходят биоимпедансометрию. Казалось бы, вот то самое число килограммов, которые нужно скинуть.

Но не весь жир – лишний. Он нужен для обменных процессов, теплоизоляции, в качестве запасенной энергии.

Оптимальный уровень жира для женщин – 20-29,9%, для мужчин – 10-19,9% от общего веса.

Используя эту информацию, расшифровка результатов биоимпедансометрии, станет намного легче и понятнее.

Показания и противопоказания к биоимпедансометрии

Кому будет полезна биоимпедансометрия?

• людям, которые хотят изменить мышечную массу, то есть посетителям тренажерных залов, спортсменам, а также занятым лечебной физкультурой, восстановлением после болезней и травм;
• следующим различным диетам и желающим сравнить их эффективность;
• страдающим эндокринными заболеваниями, заболеваниями печени, почек, сердечнососудистой системы, то есть болезнями, влияющими на вес;
• людям с лишним или недостаточным весом до и во время лечения для лучшего контроля за результатами;
• желающим лучше узнать свое тело, чтобы разумнее о нем заботиться.

Биоимпедансометрия противопоказана:

• беременным женщинам;
• людям с водителями сердечного ритма (электрические импульсы могут повлиять на их работу).

Неточности и ошибки

Биоимпедансный анализ – вполне научная разработка, и при правильном выполнении весьма точен и полезен. Однако от ошибок не застрахован ни один метод.

https://youtube.com/watch?v=8vwhf3AQlhc

Начнем с того, что процедуру должен проводить квалифицированный персонал, который отлично разбирается в конкретном приборе. Неверное наложение датчиков (с отклонением даже в 1 сантиметр) ведет к искажению результатов.

Электрический импульс идет по пути наименьшего сопротивления, и, в зависимости от насыщенности тела водой, может обойти, «не увидеть» некоторые жировые отложения. Также это зависит и от модели биоимпедансного анализатора.

Некоторые просто пропускают целые секции тела, например, когда заряд проходит через ноги от одной ступни до другой (при этом анализ пропускает весь торс) или через руки от одной ладони до другой (нижняя половина тела в анализ не попадает).

  К показаниям такого рода приборов нужно относиться с известной долей недоверия.

Но даже на самом чувствительном приборе и при идеально выполненной процедуре погрешность в определении жировой массы достигает 8-9%, как показывают исследования. То есть, вы можете сбросить 4% жира, но биоимпедансометрия покажет, что вы набрали 4%. Это, конечно, может запутать и незаслуженно разочаровать вас в диете и упражнениях, которым вы себя посвятили.

Лучше всего делать биоимпедансометрию не часто, а раз в несколько месяцев, чтобы потеря или набор веса был более заметным, и погрешности не сбивали с толку и не скрывали общую динамику.

Чего следует ожидать: процедура и цена биоимпедансометрии

Сама биоимпедансометрия занимает всего 10-20 минут, но перед этим вас взвесят, измерят рост, объем запястий, и врач внесет эти данные в программу, добавив сведения о возрасте и поле. Это понадобится, чтобы компьютер рассчитал результаты.

Приборы, как уже было упомянуто выше, бывают очень разные, но от вас, в общем, ничего особенного не требуется, только взяться за датчики (встать на них, дать закрепить на себе) и подождать. Это безболезненно, вы ничего не почувствуете, так как ток очень слабый.

Чтобы биоимпедансометрия показала точный результат, следует:

• опорожнить мочевой пузырь за полчаса до процедуры;
• в течение двух суток до обследования не пить алкоголь, чай и кофе;
• если перепад между температурой на улице и в помещении большой, то дать телу акклиматизироваться: если вы замерзли или перегрелись, анализатор будет ошибаться;
• надеть свободную одежду, никакого утягивающего белья и колготок: одежда не должна менять конфигурацию тканей.

На данный момент цена биоимпедансометрии от 700 рублей и выше (от 2000, если включает подробную консультацию диетолога). Сделать ее можно в любой частной клинике общего профиля.

Теперь вам легче будет принять информированное решение, нужен ли вам биоимпедансный анализ и что вы рассчитываете от него получить.

Здоровья вам и красоты!

Источник: http://womanonly.ru/krasota_i_moda/zdorove/bioimpedansometrija_-_chto_jeto_takoe

Биоинформатика

Министерствообразования и науки Украины

Одесскийнациональный университет имени И. И.Мечникова

Биологическийфакультет

Н.Ю. Васильева

методическиеуказания

Одесса

2013

ББК28.070

УДК575.112:004

ВасильеваН. Ю. Биоинформатика. Методическиеуказания. –– Одесский национальныйуниверситет имени И. И. Мечникова, 2013.– 70с.

Вметодических указаниях рассмотреныосновные принципы работы с биологическимипоследовательностями (множественноеи парное выравнивание, построениефилогенетических деревьев), которыепредусмотрены программой курса«Биоинформатика».

Достаточно большоевнимание уделено on-lineпрограммам, которые доступны любомупользователю и могут быть хорошимподспорьем студентам биологам наначальных этапах изучения этого курса.

Методические указания снабжены большимколичеством иллюстраций, позволяющимстудентам самостоятельно разобратьсяс последовательностью действий.Методические указаниях предназначеныдля студентов 4 курса биологическогофакультета ОНУ.

Составитель:кандидат биологических наук, доценткафедры микробиологии, вирусологии ибиотехнологии Одесского национальногоуниверситета имени И. И. МечниковаВасильева Н. Ю.

Рецензенты:

ГудзенкоТ. В. – доцент, кандидат биологическихнаук, доцент кафедры микробиологии,вирусологии и биотехнологии Одесскогонационального университета имени И. И.Мечникова.

МиросьС. Л. – доцент, кандидат биологическихнаук, доцент кафедры генетики имолекулярной биологии Одесскогонационального университета имени И. И.Мечникова.

Печатаетсяпо решению Ученого совета Биологическогофакультета университета имени И. И.Мечникова

Протокол № 2 от 10.10. 2013 г.

Введение……………………………………………………………………….…3

Выравниваниебиологических последовательностей…………………….……5

Типывыравнивания………………………………………………………………..7

Матрицызамен…………………………………………………………………….11

Множественноевыравнивание…………………………………………………..15

Этапывыполнения множественного выравнивания в программе

ClustalW..……………………………………………………….……….…………18

Примермножественного выравнивания………………………………..……….25

Этапывыполнения множественного выравниванияв программе

MUSCLE..……………………………………………………….……….………..34

Этапывыполнения множественного выравниванияв базе данных

UniProt..……………………………………………………….……….…………..37

Выполнениемножественного выравнивания в программеMatLab.……………41

Конструированиефилогенетических деревьевна основании

множественноговыравнивания.…………………..……………………………….45

Этапывыполнения филогенетического анализав пакетеPhylogeny.fr……….46

Конструированиефилогенетических деревьев в программеMatlab…………….53

Списокиспользованнойлитературы…………………………………………………………..70

Введение

Биоинформатика – это наука о хранении, извлечении, организации, анализе, интерпретации и использовании биологическойинформации.

Датой выделения биоинформатики в отдельную научную область можно считать 1980 год, когда началось издание журнала Nucleic AcidsResearch,целиком посвящённого компьютернымметодам анализа последовательностей.

Основополагающий принцип биоинформатики состоит в том, что

биополимеры,например, молекулы нуклеиновых кислоти белков, могут быть изображены в видепоследовательности цифровых символов.Кроме того, для представления мономеров аминокислотных и нуклеотидных цепейнеобходимо лишь ограниченное числоалфавитных знаков. Подобная гибкостьанализа биомолекул с помощью ограниченныхалфавитов привела к успешному становлениюбиоинформатики [5].

Триединаяцель биоинформатикивключает в себя:

1) организацию и сохранение биологическихданных;

2) разработку программных средств и создание специализированных информационныхресурсов;

3) автоматизацию анализа биологическихданных, интерпретацию и использованиеполученных результатов.

Предметомучебнойдисциплин “Биоинформатика”являются компьютерно-ориентированные методы решения информационных задачв биологии и в частности микробиологии.

Длясамостоятельной работы выделяетсябольше половины общего объёма времени, предназначенного для изучения данной дисциплины.

Самостоятельная работа проводится по всем темам, входящим в дисциплину. В процессе самостоятельной работы студент учитсясамостоятельно приобретать знания,которые затем используются в ходевыполнения индивидуального задания, практических занятий, при подготовкек выполнению контрольных работ и ктестированию.

Источник: https://StudFiles.net/preview/4030558/